Hai đội Viettel và Sông Lam Nghệ An cũng được 7 điểm nhưng kém hiệu số nên xếp ở vị trí thứ 2 và 3.
CLB Hà Nội được 6 điểm sau chiến thắng 3 - 0 trước Hoàng Anh Gia Lai, xếp ở vị trí thứ 4.
Hai đội Thanh Hóa và Đà Nẵng sau 3 trận toàn thua, nằm ở nhóm cuối bảng.
Bảng xếp hạng sau vòng 3:
Kết quả cụ thể vòng 3: (ngày 5 và 6-6)
Quảng Nam - Thanh Hóa: 2 - 1
Sông Lam Nghệ An - Đà Nẵng: 1 - 0
Than Quảng Ninh - Hồng Lĩnh Hà Tĩnh: 0 - 2
Hà Nội - Hoàng Anh Gia Lai: 3 - 0
Hải Phòng - TP Hồ Chí Minh: 0 - 0
Nam Định - Viettel: 1 - 2
Sài Gòn - Bình Dương: 0 - 0
